Obwohl Mulder nicht mehr für die X-Akten zuständig ist, macht er Doggett auf den mysteriösen Tod eines Arbeiters auf einer Bohrinsel im Golf von Mexiko aufmerksam. Scully findet bei der Obduktion der Leiche heraus, dass der Tote von Natur aus gegen das Alien-Virus resistent war - im Gegensatz zu den restlichen Arbeitern auf der Plattform.
Doch ihre Warnung erreicht Mulder und Doggett zu spät: Die beiden werden von der infizierten Mannschaft angegriffen.
Als ein britisches und ein sowjetisches U-Boot spurlos verschwinden, wird Super-Agent James Bond zusammen mit seiner hübschen russischen Kollegin Anya Amasova auf den mysteriösen Fall angesetzt. Gemeinsam sollen sie die bösen Pläne von Bonds Erzfeind, dem größenwahnsinnigen Bösewicht Karl Stromberg, durchkreuzen, der die Welt mit Atombomben, die auf Moskau und New York City gerichtet sind,... James Bond 007 - Der Spion, der mich liebte